Protein–RNA interactions for Protein: O43251

RBFOX2, RNA binding protein fox-1 homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX2O43251 COBLL1-206ENST00000434366 519 ntTSL 513.74□□□□□ -0.211e-7■■■■□ 26.7
RBFOX2O43251 COBLL1-217ENST00000483743 541 ntTSL 513.7□□□□□ -0.221e-7■■■■□ 26.7
RBFOX2O43251 HNF4A-207ENST00000609262 540 ntTSL 1 (best)13.36□□□□□ -0.271e-7■■■■□ 26.7
RBFOX2O43251 COBLL1-205ENST00000414843 575 ntTSL 413.26□□□□□ -0.291e-7■■■■□ 26.7
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RBFOX2O43251 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.41e-7■■■■□ 26.7
RBFOX2O43251 SLC19A1-205ENST00000443742 777 ntTSL 312.09□□□□□ -0.471e-7■■■■□ 26.7
RBFOX2O43251 COBLL1-208ENST00000444537 737 ntTSL 512.07□□□□□ -0.481e-7■■■■□ 26.7
RBFOX2O43251 COBLL1-207ENST00000439313 565 ntTSL 511.38□□□□□ -0.591e-7■■■■□ 26.7
RBFOX2O43251 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.621e-7■■■■□ 26.7
RBFOX2O43251 SLC19A1-211ENST00000528477 580 ntTSL 410.99□□□□□ -0.651e-7■■■■□ 26.7
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RBFOX2O43251 FAM156A-203ENST00000611661 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.741e-7■■■■□ 26.7
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RBFOX2O43251 FAM156A-202ENST00000610625 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 38.67□□□□□ -1.021e-7■■■■□ 26.7
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RBFOX2O43251 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.411e-7■■■■□ 26.7
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RBFOX2O43251 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.154e-9■■■■□ 26.7
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RBFOX2O43251 DMKN-237ENST00000472252 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.214e-9■■■■□ 26.7
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RBFOX2O43251 DMKN-268ENST00000602781 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.374e-9■■■■□ 26.7
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RBFOX2O43251 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.134e-8■■■■□ 26.7
RBFOX2O43251 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.054e-8■■■■□ 26.7
RBFOX2O43251 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.034e-8■■■■□ 26.7
RBFOX2O43251 MFSD10-208ENST00000509676 1178 ntTSL 512.61□□□□□ -0.394e-8■■■■□ 26.7
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RBFOX2O43251 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.084e-7■■■■□ 26.7
RBFOX2O43251 SORBS3-201ENST00000240123 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.794e-7■■■■□ 26.7
RBFOX2O43251 ESRP2-212ENST00000569964 572 ntTSL 313.65□□□□□ -0.223e-9■■■■□ 26.7
RBFOX2O43251 ESRP2-207ENST00000564382 592 ntTSL 412.85□□□□□ -0.353e-9■■■■□ 26.7
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RBFOX2O43251 ESRP2-205ENST00000562738 590 ntTSL 411.96□□□□□ -0.493e-9■■■■□ 26.7
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RBFOX2O43251 ESRP2-208ENST00000564465 734 ntTSL 37.95□□□□□ -1.143e-9■■■■□ 26.7
RBFOX2O43251 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.441e-9■■■■□ 26.7
RBFOX2O43251 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.221e-9■■■■□ 26.7
RBFOX2O43251 CASP9-207ENST00000447522 954 ntTSL 314.52□□□□□ -0.091e-9■■■■□ 26.7
RBFOX2O43251 CASP9-208ENST00000469637 725 ntTSL 311.11□□□□□ -0.631e-9■■■■□ 26.7
RBFOX2O43251 NGDN-211ENST00000556699 725 ntTSL 24.34□□□□□ -1.713e-9■■■■□ 26.6
RBFOX2O43251 DNM2-218ENST00000591701 863 ntTSL 310.68□□□□□ -0.71e-6■■■■□ 26.6
RBFOX2O43251 DNM2-209ENST00000587485 530 ntTSL 46.15□□□□□ -1.421e-6■■■■□ 26.6
RBFOX2O43251 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.658e-11■■■■□ 26.6
RBFOX2O43251 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.668e-11■■■■□ 26.6
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