Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms