Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TULP1O00294 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TULP1O00294 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TULP1O00294 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TULP1O00294 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TULP1O00294 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TULP1O00294 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TULP1O00294 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TULP1O00294 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TULP1O00294 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TULP1O00294 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TULP1O00294 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TULP1O00294 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TULP1O00294 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TULP1O00294 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TULP1O00294 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TULP1O00294 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TULP1O00294 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TULP1O00294 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TULP1O00294 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TULP1O00294 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TULP1O00294 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TULP1O00294 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TULP1O00294 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TULP1O00294 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TULP1O00294 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TULP1O00294 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TULP1O00294 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TULP1O00294 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TULP1O00294 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TULP1O00294 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TULP1O00294 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TULP1O00294 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TULP1O00294 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TULP1O00294 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TULP1O00294 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TULP1O00294 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TULP1O00294 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TULP1O00294 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TULP1O00294 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TULP1O00294 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TULP1O00294 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TULP1O00294 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TULP1O00294 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TULP1O00294 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TULP1O00294 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TULP1O00294 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TULP1O00294 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TULP1O00294 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TULP1O00294 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TULP1O00294 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TULP1O00294 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TULP1O00294 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TULP1O00294 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TULP1O00294 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TULP1O00294 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TULP1O00294 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TULP1O00294 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TULP1O00294 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TULP1O00294 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TULP1O00294 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TULP1O00294 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TULP1O00294 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TULP1O00294 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TULP1O00294 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TULP1O00294 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TULP1O00294 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TULP1O00294 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TULP1O00294 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TULP1O00294 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TULP1O00294 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TULP1O00294 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TULP1O00294 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TULP1O00294 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TULP1O00294 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TULP1O00294 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TULP1O00294 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TULP1O00294 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TULP1O00294 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TULP1O00294 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TULP1O00294 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TULP1O00294 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TULP1O00294 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TULP1O00294 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TULP1O00294 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TULP1O00294 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TULP1O00294 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TULP1O00294 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TULP1O00294 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TULP1O00294 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TULP1O00294 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TULP1O00294 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TULP1O00294 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TULP1O00294 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TULP1O00294 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TULP1O00294 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TULP1O00294 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TULP1O00294 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TULP1O00294 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TULP1O00294 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms