Protein–RNA interactions for Protein: A8MYB1

TMCO5B, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5BA8MYB1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms