Protein–RNA interactions for Protein: A6NK53

ZNF233, Zinc finger protein 233, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF233A6NK53 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms