Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEMP2A6NFY4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms