Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms