Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms