Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms