Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms