Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ3

BARX2, Homeobox protein BarH-like 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARX2Q9UMQ3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BARX2Q9UMQ3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BARX2Q9UMQ3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BARX2Q9UMQ3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BARX2Q9UMQ3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BARX2Q9UMQ3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BARX2Q9UMQ3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
BARX2Q9UMQ3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BARX2Q9UMQ3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BARX2Q9UMQ3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BARX2Q9UMQ3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BARX2Q9UMQ3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms