Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
ZNF608Q9ULD9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
ZNF608Q9ULD9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ZNF608Q9ULD9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ZNF608Q9ULD9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ZNF608Q9ULD9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ZNF608Q9ULD9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ZNF608Q9ULD9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ZNF608Q9ULD9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
ZNF608Q9ULD9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ZNF608Q9ULD9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ZNF608Q9ULD9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
ZNF608Q9ULD9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
ZNF608Q9ULD9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ZNF608Q9ULD9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
ZNF608Q9ULD9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
ZNF608Q9ULD9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
ZNF608Q9ULD9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
ZNF608Q9ULD9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
ZNF608Q9ULD9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
ZNF608Q9ULD9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
ZNF608Q9ULD9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
ZNF608Q9ULD9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC35.97■■■■□ 3.35
ZNF608Q9ULD9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
ZNF608Q9ULD9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
ZNF608Q9ULD9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
ZNF608Q9ULD9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
ZNF608Q9ULD9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
ZNF608Q9ULD9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
ZNF608Q9ULD9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
ZNF608Q9ULD9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
ZNF608Q9ULD9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
ZNF608Q9ULD9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
ZNF608Q9ULD9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
ZNF608Q9ULD9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
ZNF608Q9ULD9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
ZNF608Q9ULD9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
ZNF608Q9ULD9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
ZNF608Q9ULD9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
ZNF608Q9ULD9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
ZNF608Q9ULD9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
ZNF608Q9ULD9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
ZNF608Q9ULD9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
ZNF608Q9ULD9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
ZNF608Q9ULD9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
ZNF608Q9ULD9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
ZNF608Q9ULD9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC35.93■■■■□ 3.34
ZNF608Q9ULD9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
ZNF608Q9ULD9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
ZNF608Q9ULD9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
ZNF608Q9ULD9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
ZNF608Q9ULD9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
ZNF608Q9ULD9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
ZNF608Q9ULD9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
ZNF608Q9ULD9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
ZNF608Q9ULD9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
ZNF608Q9ULD9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
ZNF608Q9ULD9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
ZNF608Q9ULD9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
ZNF608Q9ULD9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
ZNF608Q9ULD9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
ZNF608Q9ULD9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
ZNF608Q9ULD9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
ZNF608Q9ULD9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
ZNF608Q9ULD9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
ZNF608Q9ULD9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
ZNF608Q9ULD9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
ZNF608Q9ULD9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC35.9■■■■□ 3.34
ZNF608Q9ULD9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
ZNF608Q9ULD9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
ZNF608Q9ULD9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
ZNF608Q9ULD9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
ZNF608Q9ULD9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
ZNF608Q9ULD9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
ZNF608Q9ULD9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
ZNF608Q9ULD9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
ZNF608Q9ULD9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
ZNF608Q9ULD9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
ZNF608Q9ULD9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
ZNF608Q9ULD9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
ZNF608Q9ULD9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
ZNF608Q9ULD9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
ZNF608Q9ULD9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.34
ZNF608Q9ULD9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC35.88■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms