Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNA9Q9UGM1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms