Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FANCLQ9NW38 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms