Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms