Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms