Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ79

CRTAC1, Cartilage acidic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTAC1Q9NQ79 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRTAC1Q9NQ79 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms