Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms