Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNCQ9H7C4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms