Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M0

Exosc7, Exosome complex exonuclease RRP42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc7Q9D0M0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Exosc7Q9D0M0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms