Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXL1

Tmem50a, Transmembrane protein 50A, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem50aQ9CXL1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem50aQ9CXL1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem50aQ9CXL1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem50aQ9CXL1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem50aQ9CXL1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem50aQ9CXL1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem50aQ9CXL1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem50aQ9CXL1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem50aQ9CXL1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem50aQ9CXL1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem50aQ9CXL1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem50aQ9CXL1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem50aQ9CXL1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem50aQ9CXL1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem50aQ9CXL1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem50aQ9CXL1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem50aQ9CXL1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem50aQ9CXL1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem50aQ9CXL1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem50aQ9CXL1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem50aQ9CXL1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem50aQ9CXL1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem50aQ9CXL1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem50aQ9CXL1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem50aQ9CXL1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem50aQ9CXL1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem50aQ9CXL1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem50aQ9CXL1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem50aQ9CXL1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem50aQ9CXL1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem50aQ9CXL1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem50aQ9CXL1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem50aQ9CXL1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem50aQ9CXL1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms