Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ5

Cmtm3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm3Q99LJ5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms