Protein–RNA interactions for Protein: Q99707

MTR, Methionine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRQ99707 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTRQ99707 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTRQ99707 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTRQ99707 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTRQ99707 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTRQ99707 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MTRQ99707 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTRQ99707 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTRQ99707 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTRQ99707 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MTRQ99707 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTRQ99707 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTRQ99707 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTRQ99707 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTRQ99707 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTRQ99707 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTRQ99707 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTRQ99707 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTRQ99707 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTRQ99707 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTRQ99707 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTRQ99707 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTRQ99707 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTRQ99707 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTRQ99707 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTRQ99707 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTRQ99707 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTRQ99707 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTRQ99707 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTRQ99707 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTRQ99707 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTRQ99707 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTRQ99707 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTRQ99707 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTRQ99707 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTRQ99707 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTRQ99707 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTRQ99707 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTRQ99707 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MTRQ99707 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTRQ99707 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTRQ99707 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTRQ99707 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MTRQ99707 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTRQ99707 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTRQ99707 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTRQ99707 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTRQ99707 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTRQ99707 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTRQ99707 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MTRQ99707 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTRQ99707 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTRQ99707 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTRQ99707 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MTRQ99707 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MTRQ99707 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTRQ99707 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTRQ99707 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTRQ99707 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTRQ99707 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTRQ99707 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTRQ99707 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTRQ99707 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTRQ99707 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTRQ99707 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTRQ99707 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTRQ99707 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTRQ99707 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTRQ99707 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTRQ99707 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MTRQ99707 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTRQ99707 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTRQ99707 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTRQ99707 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTRQ99707 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTRQ99707 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTRQ99707 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTRQ99707 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTRQ99707 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTRQ99707 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTRQ99707 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTRQ99707 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTRQ99707 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTRQ99707 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTRQ99707 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTRQ99707 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MTRQ99707 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTRQ99707 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTRQ99707 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTRQ99707 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MTRQ99707 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTRQ99707 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTRQ99707 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTRQ99707 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTRQ99707 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTRQ99707 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTRQ99707 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTRQ99707 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTRQ99707 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTRQ99707 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms