Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNGAP1Q96PV0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.4 ms