Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE7

MCEE, Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCEEQ96PE7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCEEQ96PE7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms