Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC7Q96M83 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CCDC7Q96M83 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CCDC7Q96M83 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC7Q96M83 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC7Q96M83 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC7Q96M83 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC7Q96M83 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC7Q96M83 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC7Q96M83 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC7Q96M83 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC7Q96M83 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC7Q96M83 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC7Q96M83 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC7Q96M83 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC7Q96M83 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC7Q96M83 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC7Q96M83 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC7Q96M83 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC7Q96M83 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC7Q96M83 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC7Q96M83 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC7Q96M83 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC7Q96M83 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC7Q96M83 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC7Q96M83 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC7Q96M83 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC7Q96M83 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC7Q96M83 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC7Q96M83 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC7Q96M83 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC7Q96M83 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC7Q96M83 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC7Q96M83 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms