Protein–RNA interactions for Protein: Q96GE6

CALML4, Calmodulin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALML4Q96GE6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALML4Q96GE6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALML4Q96GE6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALML4Q96GE6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALML4Q96GE6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CALML4Q96GE6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALML4Q96GE6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALML4Q96GE6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALML4Q96GE6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALML4Q96GE6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CALML4Q96GE6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALML4Q96GE6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALML4Q96GE6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALML4Q96GE6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms