Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ1

CLUAP1, Clusterin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUAP1Q96AJ1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLUAP1Q96AJ1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLUAP1Q96AJ1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CLUAP1Q96AJ1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CLUAP1Q96AJ1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLUAP1Q96AJ1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLUAP1Q96AJ1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLUAP1Q96AJ1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLUAP1Q96AJ1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLUAP1Q96AJ1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLUAP1Q96AJ1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLUAP1Q96AJ1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLUAP1Q96AJ1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLUAP1Q96AJ1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLUAP1Q96AJ1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms