Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DNAAF4Q8WXU2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms