Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBZ0

CCDC110, Coiled-coil domain-containing protein 110, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC110Q8TBZ0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC110Q8TBZ0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC110Q8TBZ0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC110Q8TBZ0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC110Q8TBZ0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC110Q8TBZ0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC110Q8TBZ0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC110Q8TBZ0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC110Q8TBZ0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC110Q8TBZ0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC110Q8TBZ0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC110Q8TBZ0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC110Q8TBZ0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC110Q8TBZ0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC110Q8TBZ0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC110Q8TBZ0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC110Q8TBZ0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC110Q8TBZ0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC110Q8TBZ0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC110Q8TBZ0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC110Q8TBZ0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC110Q8TBZ0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC110Q8TBZ0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC110Q8TBZ0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC110Q8TBZ0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC110Q8TBZ0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC110Q8TBZ0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms