Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Y2

CRACR2B, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2BQ8N4Y2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CRACR2BQ8N4Y2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms