Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ73

RPUSD2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD2Q8IZ73 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPUSD2Q8IZ73 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPUSD2Q8IZ73 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPUSD2Q8IZ73 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPUSD2Q8IZ73 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RPUSD2Q8IZ73 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPUSD2Q8IZ73 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPUSD2Q8IZ73 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPUSD2Q8IZ73 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPUSD2Q8IZ73 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPUSD2Q8IZ73 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPUSD2Q8IZ73 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPUSD2Q8IZ73 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPUSD2Q8IZ73 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPUSD2Q8IZ73 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RPUSD2Q8IZ73 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPUSD2Q8IZ73 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPUSD2Q8IZ73 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPUSD2Q8IZ73 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RPUSD2Q8IZ73 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPUSD2Q8IZ73 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPUSD2Q8IZ73 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPUSD2Q8IZ73 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPUSD2Q8IZ73 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPUSD2Q8IZ73 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPUSD2Q8IZ73 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPUSD2Q8IZ73 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPUSD2Q8IZ73 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPUSD2Q8IZ73 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPUSD2Q8IZ73 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPUSD2Q8IZ73 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPUSD2Q8IZ73 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPUSD2Q8IZ73 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPUSD2Q8IZ73 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPUSD2Q8IZ73 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RPUSD2Q8IZ73 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPUSD2Q8IZ73 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPUSD2Q8IZ73 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPUSD2Q8IZ73 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPUSD2Q8IZ73 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms