Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXX9

Ccdc169, Coiled-coil domain-containing protein 169, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc169Q8BXX9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc169Q8BXX9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc169Q8BXX9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc169Q8BXX9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc169Q8BXX9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc169Q8BXX9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc169Q8BXX9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc169Q8BXX9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc169Q8BXX9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc169Q8BXX9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc169Q8BXX9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc169Q8BXX9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc169Q8BXX9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc169Q8BXX9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc169Q8BXX9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc169Q8BXX9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc169Q8BXX9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc169Q8BXX9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc169Q8BXX9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc169Q8BXX9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms