Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW6

N4BP2, NEDD4-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP2Q86UW6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms