Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV50

RFX8, DNA-binding protein RFX8, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8Q6ZV50 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms