Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms