Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB8

EMB, Embigin, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMBQ6PCB8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EMBQ6PCB8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EMBQ6PCB8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMBQ6PCB8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMBQ6PCB8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMBQ6PCB8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMBQ6PCB8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMBQ6PCB8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMBQ6PCB8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMBQ6PCB8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMBQ6PCB8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMBQ6PCB8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMBQ6PCB8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMBQ6PCB8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EMBQ6PCB8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMBQ6PCB8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EMBQ6PCB8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EMBQ6PCB8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EMBQ6PCB8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EMBQ6PCB8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EMBQ6PCB8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EMBQ6PCB8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EMBQ6PCB8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EMBQ6PCB8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EMBQ6PCB8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EMBQ6PCB8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMBQ6PCB8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMBQ6PCB8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMBQ6PCB8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMBQ6PCB8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMBQ6PCB8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMBQ6PCB8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMBQ6PCB8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMBQ6PCB8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMBQ6PCB8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMBQ6PCB8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMBQ6PCB8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMBQ6PCB8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMBQ6PCB8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EMBQ6PCB8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMBQ6PCB8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMBQ6PCB8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMBQ6PCB8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMBQ6PCB8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMBQ6PCB8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMBQ6PCB8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMBQ6PCB8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMBQ6PCB8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms