Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr2f1Q60632 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms