Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CDCA8Q53HL2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CDCA8Q53HL2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CDCA8Q53HL2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CDCA8Q53HL2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CDCA8Q53HL2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CDCA8Q53HL2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CDCA8Q53HL2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CDCA8Q53HL2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CDCA8Q53HL2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CDCA8Q53HL2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CDCA8Q53HL2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CDCA8Q53HL2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CDCA8Q53HL2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms