Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms