Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms