Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms