Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHJ8

Rnf44, RING finger protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf44Q3UHJ8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf44Q3UHJ8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rnf44Q3UHJ8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf44Q3UHJ8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf44Q3UHJ8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf44Q3UHJ8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf44Q3UHJ8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf44Q3UHJ8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf44Q3UHJ8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf44Q3UHJ8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf44Q3UHJ8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf44Q3UHJ8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf44Q3UHJ8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf44Q3UHJ8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf44Q3UHJ8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf44Q3UHJ8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf44Q3UHJ8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf44Q3UHJ8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf44Q3UHJ8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf44Q3UHJ8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf44Q3UHJ8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf44Q3UHJ8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf44Q3UHJ8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf44Q3UHJ8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf44Q3UHJ8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf44Q3UHJ8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf44Q3UHJ8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf44Q3UHJ8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf44Q3UHJ8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf44Q3UHJ8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf44Q3UHJ8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf44Q3UHJ8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms