Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms