Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HERC1Q15751 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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