Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
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