Protein–RNA interactions for Protein: Q12045

VIK1, Spindle pole body-associated protein VIK1, yeast

Predictions only

Length 647 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VIK1	Q12045	CWC2	YDL209C	1020 nt		3.13	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	DYN2	YDR424C	279 nt		3.13	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	YDR442W	YDR442W	393 nt		3.13	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	ECM4	YKR076W	1113 nt		3.13	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	IMP1	YMR150C	573 nt		3.13	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	YMR294W-A	YMR294W-A	360 nt		3.13	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	TEX1	YNL253W	1269 nt		3.13	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	RPS11B	YBR048W	471 nt		3.13	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	HAP4	YKL109W	1665 nt		3.13	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	TIF4631	YGR162W	2859 nt		3.12	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	BUD4	YJR092W	4344 nt		3.12	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	PHO81	YGR233C	3537 nt		3.12	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	MRH4	YGL064C	1686 nt		3.12	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	MIX14	YDR031W	366 nt		3.12	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	YDR290W	YDR290W	330 nt		3.12	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	YFL051C	YFL051C	483 nt		3.12	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	TYS1	YGR185C	1185 nt		3.12	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	GRX1	YCL035C	333 nt		3.12	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	GPI13	YLL031C	3054 nt		3.12	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	RCY1	YJL204C	2523 nt		3.12	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	PMS1	YNL082W	2622 nt		3.11	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	CIN8	YEL061C	3003 nt		3.11	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	PCL2	YDL127W	927 nt		3.11	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	RRP8	YDR083W	1179 nt		3.11	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	YDR222W	YDR222W	1248 nt		3.11	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	PET130	YJL023C	1044 nt		3.11	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	AHP1	YLR109W	531 nt		3.11	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	MED11	YMR112C	396 nt		3.11	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	GOT1	YMR292W	417 nt		3.11	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	YNL162W-A	YNL162W-A	219 nt		3.11	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	PFK27	YOL136C	1194 nt		3.11	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	HUT1	YPL244C	1020 nt		3.11	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	YBR096W	YBR096W	693 nt		3.11	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	YBR242W	YBR242W	717 nt		3.11	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	ATP25	YMR098C	1839 nt		3.11	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	DNM1	YLL001W	2274 nt		3.1	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	PHO5	YBR093C	1404 nt		3.1	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	JEN1	YKL217W	1851 nt		3.1	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	RMT2	YDR465C	1239 nt		3.1	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	RPL22A	YLR061W	366 nt		3.1	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	SIC1	YLR079W	855 nt		3.1	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	INN1	YNL152W	1230 nt		3.1	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	RRG9	YNL213C	645 nt		3.1	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	RFC3	YNL290W	1023 nt		3.1	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	YPR142C	YPR142C	564 nt		3.1	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	ACA1	YER045C	1470 nt		3.09	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	CCT7	YJL111W	1653 nt		3.09	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	GRX3	YDR098C	858 nt		3.09	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	KEG1	YFR042W	603 nt		3.09	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	MTC3	YGL226W	372 nt		3.09	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	DOG2	YHR043C	741 nt		3.09	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	PCD1	YLR151C	1023 nt		3.09	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	YOR082C	YOR082C	342 nt		3.09	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	RPL19A	YBR084C-A	570 nt		3.09	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	HPA2	YPR193C	471 nt		3.09	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	TSC11	YER093C	4293 nt		3.09	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	PCI8	YIL071C	1335 nt		3.09	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	UBP14	YBR058C	2346 nt		3.09	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	INP52	YNL106C	3552 nt		3.08	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	CPR1	YDR155C	489 nt		3.08	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	SDP1	YIL113W	630 nt		3.08	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	AIM25	YJR100C	984 nt		3.08	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	USB1	YLR132C	873 nt		3.08	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	YLR363W-A	YLR363W-A	258 nt		3.08	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	YMR178W	YMR178W	825 nt		3.08	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	RPS10B	YMR230W	318 nt		3.08	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	USV1	YPL230W	1176 nt		3.08	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	YLR278C	YLR278C	4026 nt		3.08	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	TPD3	YAL016W	1908 nt		3.07	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	SRC1	YML034W	2505 nt		3.07	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	CLB3	YDL155W	1284 nt		3.07	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	VMA8	YEL051W	771 nt		3.07	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	CAB2	YIL083C	1098 nt		3.07	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	YLL047W	YLL047W	384 nt		3.07	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	YAR075W	YAR075W	474 nt		3.07	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	PSY3	YLR376C	729 nt		3.07	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	YOR263C	YOR263C	408 nt		3.07	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	BNA4	YBL098W	1383 nt		3.07	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	DBP7	YKR024C	2229 nt		3.07	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	SPO14	YKR031C	5052 nt		3.07	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	YDL186W	YDL186W	834 nt		3.06	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	HIM1	YDR317W	1245 nt		3.06	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	OTU1	YFL044C	906 nt		3.06	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	MTD1	YKR080W	963 nt		3.06	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	RUF5-1	RUF5-1	710 nt		3.06	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	RUF5-2	RUF5-2	710 nt		3.06	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	NDC80	YIL144W	2076 nt		3.05	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	CUE3	YGL110C	1875 nt		3.05	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	VAS1	YGR094W	3315 nt		3.05	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	KAR5	YMR065W	1515 nt		3.05	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	YPR148C	YPR148C	1308 nt		3.05	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	LAC1	YKL008C	1257 nt		3.05	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	MBR1	YKL093W	1020 nt		3.05	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	SEC65	YML105C	822 nt		3.05	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	RUF20	RUF20	443 nt		3.05	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	DSL1	YNL258C	2265 nt		3.05	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	CEX1	YOR112W	2286 nt		3.05	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	FLO5	YHR211W	3228 nt		3.04	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	PRP31	YGR091W	1485 nt		3.04	□□□□□ -1.92
VIK1	Q12045	MDV1	YJL112W	2145 nt		3.04	□□□□□ -1.92

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