Protein–RNA interactions for Protein: Q08004

BUD20, Bud site selection protein 20, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BUD20Q08004 YIL171W-AYIL171W-A 453 nt6.1□□□□□ -1.43
BUD20Q08004 YJL015CYJL015C 285 nt6.1□□□□□ -1.43
BUD20Q08004 RPL39YJL189W 156 nt6.1□□□□□ -1.43
BUD20Q08004 YJL220WYJL220W 453 nt6.1□□□□□ -1.43
BUD20Q08004 YJR128WYJR128W 360 nt6.1□□□□□ -1.43
BUD20Q08004 TPK3YKL166C 1197 nt6.1□□□□□ -1.43
BUD20Q08004 YML031C-AYML031C-A 336 nt6.1□□□□□ -1.43
BUD20Q08004 YOR121CYOR121C 306 nt6.1□□□□□ -1.43
BUD20Q08004 VMA2YBR127C 1554 nt6.1□□□□□ -1.43
BUD20Q08004 SUB2YDL084W 1341 nt6.09□□□□□ -1.43
BUD20Q08004 YEL068CYEL068C 333 nt6.09□□□□□ -1.43
BUD20Q08004 YGR035W-AYGR035W-A 222 nt6.09□□□□□ -1.43
BUD20Q08004 CAB4YGR277C 918 nt6.09□□□□□ -1.43
BUD20Q08004 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt6.09□□□□□ -1.43
BUD20Q08004 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt6.09□□□□□ -1.43
BUD20Q08004 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt6.09□□□□□ -1.43
BUD20Q08004 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt6.09□□□□□ -1.43
BUD20Q08004 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt6.09□□□□□ -1.43
BUD20Q08004 YKL044WYKL044W 321 nt6.09□□□□□ -1.43
BUD20Q08004 BET5YML077W 480 nt6.09□□□□□ -1.43
BUD20Q08004 ISF1YMR081C 1017 nt6.09□□□□□ -1.43
BUD20Q08004 CDC33YOL139C 642 nt6.09□□□□□ -1.43
BUD20Q08004 SRB6YBR253W 366 nt6.09□□□□□ -1.43
BUD20Q08004 DSS1YMR287C 2910 nt6.09□□□□□ -1.43
BUD20Q08004 DPH2YKL191W 1605 nt6.09□□□□□ -1.43
BUD20Q08004 YBR139WYBR139W 1527 nt6.09□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 MEC3YLR288C 1425 nt6.08□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 ASH1YKL185W 1767 nt6.08□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 HAP4YKL109W 1665 nt6.08□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 GCD2YGR083C 1956 nt6.08□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 YDL109CYDL109C 1944 nt6.08□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 YHR097CYHR097C 1101 nt6.08□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 RAD14YMR201C 1116 nt6.08□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 POP3YNL282W 588 nt6.08□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 MRPS16YPL013C 366 nt6.08□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt6.08□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 STE5YDR103W 2754 nt6.08□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 KKQ8YKL168C 2175 nt6.07□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 RTK1YDL025C 1863 nt6.07□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 PLM2YDR501W 1566 nt6.07□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 YHL017WYHL017W 1599 nt6.07□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 ARF2YDL137W 546 nt6.07□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 BNA6YFR047C 888 nt6.07□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 RPS5YJR123W 678 nt6.07□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 AFB1YLR040C 675 nt6.07□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 RPL18AYOL120C 561 nt6.07□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 YPR114WYPR114W 948 nt6.07□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 CEX1YOR112W 2286 nt6.07□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 CCZ1YBR131W 2115 nt6.07□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 AFG1YEL052W 1530 nt6.06□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 YER079C-AYER079C-A 339 nt6.06□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 CRG1YHR209W 876 nt6.06□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 YJL028WYJL028W 336 nt6.06□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt6.06□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 NRM1YNR009W 750 nt6.06□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 CTP1YBR291C 900 nt6.06□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 UTP4YDR324C 2331 nt6.06□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 HXT17YNR072W 1695 nt6.06□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 TPO3YPR156C 1869 nt6.06□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 YOL036WYOL036W 2286 nt6.05□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 RFA1YAR007C 1866 nt6.05□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 HOF1YMR032W 2010 nt6.05□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 PGK1YCR012W 1251 nt6.05□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 snR82snR82 268 nt6.05□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 GCS1YDL226C 1059 nt6.05□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 ZRT1YGL255W 1131 nt6.05□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 ERV1YGR029W 570 nt6.05□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 CIS3YJL158C 684 nt6.05□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 YLR031WYLR031W 561 nt6.05□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt6.05□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 DBP3YGL078C 1572 nt6.05□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 RMD9YGL107C 1941 nt6.05□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 YCL068CYCL068C 783 nt6.04□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 YCR101CYCR101C 549 nt6.04□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 YER023C-AYER023C-A 213 nt6.04□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 SEC53YFL045C 765 nt6.04□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 PHB1YGR132C 864 nt6.04□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 RNR4YGR180C 1038 nt6.04□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt6.04□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 YIR020CYIR020C 303 nt6.04□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 YNL184CYNL184C 327 nt6.04□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 RPL18BYNL301C 561 nt6.04□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 SOL1YNR034W 966 nt6.04□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 DGK1YOR311C 873 nt6.04□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 CAM1YPL048W 1248 nt6.04□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 IMA5YJL216C 1746 nt6.04□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 PMT5YDL093W 2232 nt6.03□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 GNT1YOR320C 1476 nt6.03□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt6.03□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt6.03□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt6.03□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 MCP2YLR253W 1710 nt6.03□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 ADY2YCR010C 852 nt6.03□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 CYC7YEL039C 342 nt6.03□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 YER038W-AYER038W-A 381 nt6.03□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 QCR6YFR033C 444 nt6.03□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 YIL156W-AYIL156W-A 402 nt6.03□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 APS3YJL024C 585 nt6.03□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 MOG1YJR074W 657 nt6.03□□□□□ -1.44
BUD20Q08004 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt6.03□□□□□ -1.44
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