Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms