Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms